Tiếp nối cha Triều có cha Giacôbê Thuận, cha Augustinô Thìn. Từ 08/1943 đến 1945 có cha Simon Tôn . Từ 1945 đến 1953 có Cha Phaolô Võ Hữu Tư, cha Phêrô Lê Đức Châu (Trà Kiệu). Vì chiến tranh, cha Châu phải về Bình Định, sau hiệp định Genève ngài trở lại Hoa Châu đến năm 1959 ngài được bổ nhiệm đi Quảng Nam.

Năm 1965, do chiến tranh, cha Minh đưa dân di tản vào Cam Ranh lập xứ Hoà Yên thuộc xã Cam Đức, Cam Ranh, Khánh Hoà. Hoa Châu trở thành hoang phế đến năm 1975.

Chiến tranh vừa kết thúc, Đức Giám Mục bổ nhiệm Cha F.X. Trần Hoà về làm quản xứ Hoa Châu. Lúc bấy giờ nhà thờ, nhà xứ Hoa Châu là cảnh hoang phế đổ nát. Cha Hoà ở tại Phú Lâm với chiếc xe đạp mini hằng ngày lên xuống Hoa Châu – Phú Lâm gầy dựng lại cơ sở Hoa Châu. Cha dùng gạch ngói gỡ từ 3 phòng học ở Phú Lâm đưa lên Hoa Châu, xây và lợp lại ngôi trường cũ dài 12m, rộng 8m, một nữa làm nhà nguyện, một nữa làm phòng ở và sinh hoạt giáo xứ. Vì nhu cầu giáo dân ngày càng đông, Cha Sở xây thêm một dãy nhà nối tiếp dài 11 mét làm phòng ở, phòng sinh hoạt giáo xứ . Phần 12m x 8m dùng làm nhà nguyện.

Trước năm 1975, Phú Lâm là một giáo điểm truyền giáo của giáo xứ Đông Mỹ. Năm 1962 Cha F.X. Trần Hoà, phụ tá Cha Sở Đông Mỹ, đến Phú Lâm làm lễ ở nhà giáo dân, Năm 1964 Cha Hoà làm Cha Sở Đông Mỹ, sau đó ngài xây một nhà nguyện diện tích 96m². Đến năm 1970, số giáo dân các vùng quê tập trung về thị trấn Phú Lâm, Cha Hoà phải xây một ngôi nhà đa dụng, tầng trệt làm phòng học, tầng trên làm nhà nguyện, mỗi tầng có diện tích 260m². Vì Hoa Châu đang cảnh đổ nát nên Phú Lâm được chọn làm cư sở của ngài. Kể từ đây Phú Lâm trở thành họ nhánh của giáo xứ Hoa Châu. Ngày nay giáo dân tại Phú Lâm khoảng 180 người. Tháng 10/2001 Phú Lâm được trao lại cho Đông Mỹ, Cha Hòa đến ở thường xuyên tại Hoa Châu.

Năm 1996, cha Hòa khởi công xây dựng và hoàn thành ngôi nhà thờ khang trang hôm nay với sự cộng tác nô nức của bà con giáo dân, khánh thành ngày 05/08/1997. Thuở đầu, nhà thờ Hoa Châu được làm tạm thời bằng mái tranh vách đất tại soi Thạch Bàn, bên bờ sông Đà Rằng (sông Ba) cách phía sau ngôi nhà thờ hôm nay khoảng hơn 01km. Theo lời viết của ông Simon Trần Nhơn trong tộc phả họ Trần ở Tuy Hoà thì thời cha Trần Huấn ở Hoa Châu, nhà thờ và nhà vuông Hoa Châu đã được ngài lợp ngói, nhà thờ nhánh Đồng Lân và Lạc Chỉ còn mái tranh. Khi Cha Tư làm quản xứ ngài đã sửa lại ngôi nhà thờ nầy. Dòng nước sông dần dần xâm thực soi Thạch Bàn, dân cư phải di dời vào phía trong, nhà thờ cũng không tồn tại với dòng nước . Cha Châu xây dựng nhà thờ mới bằng vật liệu rắn chắc gạch ngói tại vị trí hôm nay, nhà thờ nầy hoàn thành năm 1956, trong chiến tranh (1965-1975) bị bom đánh sập chỉ còn lại mặt tiền và tháp chuông được cha Hòa giữ lại cùng kết cấu với nhà thờ mới hôm nay.

Số giáo dân tại Hoa Châu gia tăng với con số 90 giáo dân vào năm 1975 tăng lên 785 vào năm 2001. Tính cả họ nhánh Sơn Giang là 964 người.

Họ Sơn Giang thuộc xã Sơn Giang huyện Sông Hinh. Đây là vùng đất bà con từ Nha Trang đến sinh sống trong chương trình kinh tế mới sau năm 1975. Năm 1989, Đức Cha Phaolô Huỳnh Đông Các giao cho Cha Hoà phụ trách số bà con giáo dân trên vùng đất nầy. Lúc đầu chỉ lên xuống làm lễ trong nhà một người giáo dân. Đến năm 1997 nhà nước thu hồi 280m² đất sử dụng của ông Nguyễn Khen đã hiến để làm nhà nguyện vì lý do : Đất gia cư không được dùng xây cất nơi thờ tự. Vào 05/0 9 /1997 nhà nước giao 510m² đất trên một gò cao thoáng mát, thuộc thôn Vĩnh Lương, xã Sơn Giang để xây dựng nhà nguyện. Nhà nguyện đã được xây dựng và mừng lễ khánh thành vào ngày 01/05/ 2002.

Số giáo dân tại họ Sơn Giang hiện nay có 179 người, nguồn kinh tế nhờ vào mía đường.

Trong bài giảng lễ khánh thành nhà nguyện Sơn Giang Đức giám mục đã nhắn nhủ bà con giáo dân:“....công khó, mồ hôi của anh chị em đã làm cho đất sỏi đá cằn khô này có được vị ngọt của mía đường....anh chị em cũng hãy nổ lực, hãy chắt chiu những giây phút cầu nguyện, những việc làm bác ái để biến đời sống khổ nhọc của anh chị em trở nên vị ngọt của tình yêu, trở thành chứng tá cho Chúa...”